Qonto vs Indy : lequel choisir pour son compte pro en 2026 ?

Qonto et Indy reviennent régulièrement dans les comparatifs de comptes pro, mais leur point de départ est radicalement différent. Voici un comparatif honnête pour comprendre lequel correspond vraiment à ton profil en 2026.

Le point essentiel à comprendre avant tout

Indy et Qonto ne sont pas vraiment des concurrents directs dans leur ADN. Indy est un logiciel de comptabilité qui propose un compte pro en complément, tandis que Qonto est un compte pro complet qui s’intègre avec des logiciels de comptabilité tiers. Le compte pro gratuit d’Indy agit en réalité comme un produit d’appel vers son vrai métier : l’automatisation comptable de bout en bout.

En un coup d’œil

QontoIndy
Métier principalBanque pro / établissement de paiementLogiciel de comptabilité
Prix de départ9 €/moisGratuit
Compta automatisée⚠️ Basique✅ Complète
Plateforme Agréée 2026
Trésorerie rémunérée✅ Jusqu’à 4%
Multi-utilisateurs avancé
Dépôt de chèques

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Une nuance importante sur la facturation électronique 2026

C’est un point souvent mal connu mais déterminant : Indy est officiellement enregistré comme Plateforme Agréée (PA) par la DGFiP pour la facturation électronique obligatoire, avec prise en charge des formats Factur-X, UBL et CII, ainsi qu’un archivage légal de 10 ans conforme. Qonto, en revanche, ne dispose pas de ce statut de Plateforme Agréée à proprement parler — elle propose un module de facturation performant, mais pour la conformité stricte à la réforme, elle s’appuie davantage sur son écosystème d’intégrations.

Si être en conformité directe avec la réforme sans devoir ajouter un outil supplémentaire est ta priorité, ce point penche clairement en faveur d’Indy.

Quand choisir Indy ?

Indy s’adresse avant tout aux indépendants et freelances seuls aux commandes — entreprise individuelle, SASU, EURL. Son but affiché est de remplacer l’expert-comptable pour les tâches courantes, ce qui te permet de reprendre la main sur ta gestion administrative sans dépendre d’un cabinet.

Indy est le bon choix si :

  • Tu es auto-entrepreneur, freelance en BNC ou en société simple
  • Tu veux automatiser ta comptabilité complète — TVA, URSSAF, liasse fiscale
  • Tu veux éviter de payer un expert-comptable pour les tâches courantes
  • Tu veux être conforme à la facturation électronique 2026 sans outil supplémentaire
  • Tu n’as pas besoin de dépôt de chèques ou d’espèces

Attention toutefois : Indy n’accepte pas les holdings, et certains secteurs d’activité spécifiques comme la restauration ou le BTP sont exclus de son service — un point de vigilance si ton activité entre dans ces catégories.

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Quand choisir Qonto ?

Qonto cible une audience plus large, des indépendants jusqu’aux PME et startups en croissance. Ses fonctionnalités bancaires étendues et sa capacité à gérer plusieurs utilisateurs avec des workflows de validation en font une solution flexible pour les entreprises qui se structurent.

Qonto est le bon choix si :

  • Tu as une TPE/PME structurée avec plusieurs collaborateurs
  • Tu as besoin d’une gestion d’équipe avancée avec workflows de validation des dépenses
  • Tu veux rémunérer ta trésorerie jusqu’à 4% par an pour les nouveaux clients
  • Tu as besoin du dépôt de chèques ou de virements internationaux fréquents
  • Tu gères déjà ta comptabilité avec un expert-comptable ou un logiciel séparé

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Comparatif détaillé

Le compte pro en lui-même

Indy n’est pas une banque pro — elle fait appel à un prestataire externe (Swan) agréé par l’ACPR pour proposer son compte. Qonto, de son côté, opère son compte pro en propre, avec une gamme de fonctionnalités bancaires nettement plus étendue : sous-comptes à IBAN dédiés pour séparer tes activités, gestion des dépenses d’équipe avec photos de justificatifs et OCR automatique, et un service client disponible 7j/7.

Les tarifs

Indy propose une structure lisible : l’offre Essentiel inclut facturation, comptabilité de base et compte pro entièrement gratuits, avec des fonctionnalités avancées payantes entre 12 € et 59 € selon le régime. Aucun engagement n’est requis, tu peux suspendre l’abonnement à tout moment. Qonto démarre à 9 €/mois et facture certains services additionnels comme les virements internationaux ou les cartes supplémentaires, ce qui peut faire grimper la facture pour une activité avec beaucoup de transactions.

La comptabilité automatisée

C’est clairement le point fort d’Indy : automatisation complète des déclarations, génération et télétransmission de la liasse fiscale avec le forfait Premium, gestion des notes de frais avec rapprochement automatique des justificatifs. Qonto a ajouté des outils d’automatisation comptable à ses services, mais cette fonctionnalité reste plus récente et moins aboutie que le cœur de métier d’Indy.

Peut-on utiliser les deux ensemble ?

Oui, c’est même une stratégie assez répandue chez certains entrepreneurs : utiliser Qonto comme compte bancaire principal pour ses fonctionnalités avancées, tout en s’appuyant sur Indy ou un autre logiciel pour la partie comptable pure. Cette combinaison permet de cumuler le meilleur des deux approches, au prix de gérer deux outils en parallèle plutôt qu’un seul.

Le verdict

Choisis Indy si tu es indépendant et que ta priorité est d’automatiser ta comptabilité tout en ayant un compte pro gratuit en complément, avec une vraie conformité native à la facturation électronique 2026.

Choisis Qonto si tu as une structure qui grandit, que tu as besoin de fonctionnalités bancaires avancées et de gestion d’équipe, et que tu gères ta comptabilité par ailleurs.

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FAQ — Qonto vs Indy

Indy est-il vraiment gratuit pour le compte pro ?
Oui, le compte pro d’Indy est entièrement gratuit, avec IBAN français et carte Mastercard. Les fonctionnalités comptables avancées comme la liasse fiscale nécessitent un plan payant.

Indy est-il une Plateforme Agréée pour la facturation électronique 2026 ?
Oui, Indy est officiellement immatriculé comme Plateforme Agréée par la DGFiP, contrairement à Qonto qui ne dispose pas de ce statut spécifique.

Qonto rémunère-t-il la trésorerie ?
Oui, Qonto propose une rémunération pouvant aller jusqu’à 4% par an pour les nouveaux clients pendant une durée limitée, puis jusqu’à 2% selon le forfait choisi. Indy ne propose pas cette fonctionnalité.

Peut-on déposer des chèques avec Indy ?
Non, Indy ne propose pas le dépôt de chèques ou d’espèces, contrairement à Qonto qui le permet selon certaines modalités.

Quel est le meilleur choix pour une SASU ou une SARL ?
Cela dépend de ta priorité : Indy pour automatiser ta comptabilité de société avec une liasse fiscale incluse, Qonto si tu as une équipe à gérer et que tu délègues ta comptabilité à un expert-comptable.

Indy accepte-t-il tous les secteurs d’activité ?
Non, Indy exclut notamment les holdings et certains secteurs spécifiques comme la restauration ou le BTP. Vérifie l’éligibilité de ton activité avant de t’inscrire.


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Dernière mise à jour : juin 2026 — Tarifs et fonctionnalités vérifiés sur les sites officiels de Qonto et Indy.


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